南京大学医学院附属泰康仙林鼓楼医院感染性疾病科目前下设发热门诊和肠道门诊，主要针对呼吸道传染病和肠道传染病进行筛查、治疗和转诊。同时，科室承担全院感染性疾病的会诊任务，指导各临床科室抗生素使用，特别是为疑难和重症感染、多重耐药菌感染以及发热待查的诊断和治疗提供专科指导，确保每一位住院感染患者得到专业临床服务。此外，科室还负责全院传染病审核上报、数据分析、公共卫生事件处理工作，落实完成疾控下达的各项传染病防控任务。后期将视病人数量增设肝炎门诊，开展病毒性肝炎的抗病毒治疗和体检业务。